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Rubicon R300669 DNA-Seq DNA測序文庫構建
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 Rubicon R300669 DNA-Seq DNA測序文庫構建
適用于以下細胞類型的文庫制備：
癌癥研究：循環腫瘤細胞（CTC）,激光捕獲顯微切割（LCM）細胞或DNA，
以及細針抽吸（FNA）細胞；
生殖健康研究：胚胎細胞和循環胎兒細胞；
發育生物學：胚胎細胞，干細胞和稀有細胞；
宏基因組學和微生物學：微生物細胞，微生物組和環境樣品。
  Rubicon R300669 DNA-Seq DNA測序文庫構建的詳細資料：

歡迎您致電 重慶市華雅干細胞技術有限公司 189 9633 2596  Q 3148795229

華雅干細胞-客服中心：023-630105781

Rubicon R300669 DNA-Seq DNA測序文庫構建

品牌：Rubicon Genomics

貨號：R300669

規格：24Rxns

Rubicon R300669 DNA-Seq DNA測序文庫構建

單細胞起始的DNA測序文庫構建

SMARTer® PicoPLEX® Gold Single Cell DNA-Seq Kit

· 高重現性和準確性：可用于CNV、SNV和非整倍體檢測
· 在SNV和CNV檢測方面優于MDA技術
· 三小時的工作流程，手動操作時間不到30分鐘
· 均勻的高覆蓋率，低的等位基因插入率和脫扣率

應用：

適用于以下細胞類型的文庫制備：

· 癌癥研究：循環腫瘤細胞（CTC）,激光捕獲顯微切割（LCM）細胞或DNA，
   以及細針抽吸（FNA）細胞；
· 生殖健康研究：胚胎細胞和循環胎兒細胞；
· 發育生物學：胚胎細胞，干細胞和稀有細胞；
· 宏基因組學和微生物學：微生物細胞，微生物組和環境樣品。

 

歡迎您致電 重慶市華雅干細胞技術有限公司 189 9633 2596  Q 3148795229

華雅干細胞-客服中心：023-630105781

產品說明：
SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit
SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit (PicoPLEX Gold) 是一種旨在從單細胞中生成高質量的DNA文庫，以便在Illumina平臺進行測序的試劑盒。該試劑盒基于PicoPLEX技術，優化用于檢測拷貝數變異 (CNVs)、單核苷酸變異 (SNVs)、插入缺失 (indels) 和結構變異 (SV)。PicoPLEX Gold kit在SNV檢測中表現出比MDA技術更好的性能。 
SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit不包含index。兼容的SMARTer Index如下所述，需要單獨購買。
PicoPLEX WGA是一種在被廣泛用于檢測單細胞中CNV的全基因組擴增（WGA）技術。初，PicoPLEX技術主要用于高再現性的檢測非整倍體異倍性和CNV。為了滿足準確檢測SNV的需求，對PicoPLEX WGA技術中的酶、引物和protocols進行了進一步優化，不僅提升了擴增的覆蓋度、*性、準確性，同時提高了CNV、SNV、Indel和其他SV的分辨率，并且保持了高重現性。
SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit可以固定細胞或非固定細胞起始，只需簡單的4步操作流程，即可在3小時內完成Illumina NGS文庫的構建，且手動操作時間非常短。
 

SMARTer DNA HT dual index kits

SMARTer DNA HT dual index kits是與SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文庫制備試劑盒搭配使用，用以構建Illumina測序文庫的index引物試劑盒。這些試劑盒包含Illumina Nextera® XT v2 index序列對應的index引物，多可提供384種不同的雙端index，用于樣本混合測序時的區分。其中index引物預先分裝在4個的不同條形碼標記的index微孔板中，每個微孔板可提供不同的96種index組合 (Code No.R400660-R400663)，index微孔板（96N Sets A-D）的每個孔提供的量足夠進行一次測序反應；另一種是一套中有24個單獨的反應管，每個反應管中包含不同的雙端index組合（Code No.R400664），且每個反應管（24N）提供的量足夠進行兩次測序反應。
 

SMARTer DNA unique dual index kits

SMARTer DNA unique dual index kits是與SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文庫制備試劑盒搭配使用，用以構建Illumina測序文庫的index引物試劑盒。這些試劑盒包含“IDT for Illumina UD”對應的index引物，多可提供96種不同雙端index，用于樣本混合測序時的區分。index引物預先分裝在不同的4組各24個單獨的管中，其中每組可提供24種不同index引物組合（Code No.R400665-R400668）。每個index引物管（24U Sets A-D）提供的量足夠進行兩次測序反應。
 

SMARTer DNA single index kits

SMARTer DNA single index kits是與SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文庫制備試劑盒搭配使用，用以構建Illumina測序文庫的index引物試劑盒。這些試劑盒包含與“TruSeq LT set A”序列對應的index引物，可提供24種單端index，用于樣本混合測序時的區分。index引物預先分裝在不同的2組各12個單獨的管中，其中每組可提供12種不同index引物組合（Code No.R400695和R400697）。每個index引物管（12U Sets A-B）提供的量足夠進行8次測序反應。
 

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圖1. SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit技術。
PicoPLEX Gold的技術概要。通過step1裂解細胞獲得gDNA，通過隨機引物進行預擴增 (step 2)，然后進行指數擴增得到測序文庫（step 4）。
 
圖2. PicoPLEX Gold的主要特點：高覆蓋度，高均勻性，和高重現性 (與A產品技術相比)。
Panel A. 圖中顯示在不同深度的測序中覆蓋的堿基數 (～35M read pairs，PE 2 × 150 bp) 。PicoPLEX Gold在較低深度的覆蓋度與A產品 (MDA) 相似，在較高深度的覆蓋度高于A產品（MDA）。
Panel B. 以gDNA樣本 (NA12878) 和單細胞樣本 (GM12878) 起始，使用PicoPLEX Gold和A產品進行全基因組擴增。相比較于MDA，PicoPLEX Gold顯示出更均勻的覆蓋度。
Panel C. 評估覆蓋度的重現性。與A產品 (右) 相比，PicoPLEX Gold (左) 的在兩個單細胞群之間的*性明顯更好。
 

圖3. 使用PicoPLEX Gold進行高質量單核苷酸變異（SNV）檢測。
Panel A. 以單細胞（1c），5個細胞（5c）或15 pg的 NA12878 gDNA起始，比較A產品（MDA），PicoPLEX Gold（PP Gold）和SMARTer PicoPLEX WGA（PP WGA）這3個試劑盒之間的SNV檢測率。其中1個和5個細胞的測序深度為35M read pairs， gDNA樣品深度為40M read pairs。PicoPLEX Gold（藍色）有高的保真度和覆蓋度，與A產品（灰色）和PicoPLEX WGA（紫色）相比，可以高質量的檢測更多的SNV（2-9倍），具有明顯的優勢。
Panel B. PicoPLEX Gold（藍色）的B等位基因頻率的對稱分布，以0.5為中心，展示兩個等位基因的平衡情況。與A產品（MDA）相比，PicoPLEX具有更好的等位基因平衡（灰色）。
Panel C. PicoPLEX Gold的無偏擴增, 在測試的所有單細胞文庫制備的技術中，表現出低的等位基因脫扣率（假陰性）。
Panel D. PicoPLEX Gold試劑盒中的聚合酶具有高保真度（藍色），使得等位基因插入率與A產品（灰色）相當，且顯著低于PicoPLEX WGA（紫色）。

 

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Rubicon擁有ThruPLEX®和PicoPLEX®技術。特殊的引物或接頭設計，能以微量DNA樣本起始構建下一代測序文庫。

ThruPLEX DNA-seq  Kit

 更高的通量, 更好的性能, 用于所有 Illumina® 的 NGS 平臺

更高的通量–多達 96 個 index

微量起始樣品（50 pg – 50 ng），更高性能

快速簡單的實驗方法：一根管或孔中，僅三步反應，約 2 小時時間，無需轉移

適用于所有主要的靶向富集平臺–安捷倫 SureSelect® Enrichment，羅氏 NimbleGen® SeqCap EZ®，IDT xGEN® LockDown® probes

 ThruPLEX Plasma-seq Kit

 專為血漿游離DNA設計

專為cfDNA設計：修復及連接試劑配方更新，方法優化

高品質NGS文庫：在寬廣的GC含量范圍內，可以達到高檢測再現性

起始量范圍廣：＜1 ng到30 ng cfDNA量

快速簡便：單管、2小時、3步操作步驟，無需純化或樣品轉移步驟

應用領域：液體活檢、ctDNA、靶向測序等領域文庫構建

兼容自動化平臺：Beckman® FXP Workstation

Takara&Clontech NGS系列產品

品牌/生產廠家產品編號產品名稱單位
Rubicon GenomicsR300381PicoPLEX DNA-seq Kit48Rxns
Rubicon GenomicsR30050PicoPLEX WGA Kit50Rxns
Rubicon GenomicsR300644PicoPLEX WGA Kit 500Rxns
Rubicon GenomicsR300669SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-seq Kit24Rxns
Rubicon GenomicsR300670SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-seq Kit96Rxns
Rubicon GenomicsR300698SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-seq Kit384Rxns
Rubicon GenomicsR300671SMARTer PicoPLEX Single Cell WGA Kit24Rxns
Rubicon GenomicsR300672SMARTer PicoPLEX Single Cell WGA Kit96Rxns
Rubicon GenomicsR300673SMARTer PicoPLEX Single Cell WGA Kit480Rxns
Rubicon GenomicsR400406ThruPLEX DNA-seq 48D Kit48Rxns
Rubicon GenomicsR400407ThruPLEX DNA-seq 96D Kit96Rxns
Rubicon GenomicsR400427ThruPLEX DNA-seq 48S Kit48Rxns
Rubicon GenomicsR400428ThruPLEX DNA-seq 12S (48)Kit48Rxns
Rubicon GenomicsR400490ThruPLEX Plasma-seq 12S Kit12Rxns
Rubicon GenomicsR400491ThruPLEX Plasma-seq 48S Kit48Rxns
Rubicon GenomicsR400492ThruPLEX Plasma-seq 96D Kit96Rxns
Rubicon GenomicsR400523ThruPLEX DNA-seq 6S (12 )Kit12Rxns
Rubicon GenomicsR400584ThruPLEX Tag-seq 6S（12）Kit12Rxns
Rubicon GenomicsR400585ThruPLEX Tag-seq 48S Kit48Rxns
Rubicon GenomicsR400586ThruPLEX Tag-seq 96D Kit96Rxns

 

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產品相關關鍵字： DNA測序文庫構建 單細胞DNA-Seq分析 授權代理 循環腫瘤細胞（CTC） Takara R300669
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